fix: restore missing files (package.json etc) and fix sync script logic

docs/zh-TW/commands/refactor-clean.md

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+# 重構清理
+
+透過測試驗證安全地識別和移除無用程式碼：
+
+1. 執行無用程式碼分析工具：
+   - knip：找出未使用的 exports 和檔案
+   - depcheck：找出未使用的相依性
+   - ts-prune：找出未使用的 TypeScript exports
+
+2. 在 .reports/dead-code-analysis.md 產生完整報告
+
+3. 依嚴重性分類發現：
+   - 安全：測試檔案、未使用的工具
+   - 注意：API 路由、元件
+   - 危險：設定檔、主要進入點
+
+4. 只提議安全的刪除
+
+5. 每次刪除前：
+   - 執行完整測試套件
+   - 驗證測試通過
+   - 套用變更
+   - 重新執行測試
+   - 如果測試失敗則回滾
+
+6. 顯示已清理項目的摘要
+
+在執行測試前絕不刪除程式碼！